Родился в Северодвинске 21 января 1948 года, окончил школу № 1.
В 1966 году пришел в цех № 50 Севмаша учеником слесаря-монтажника. В 1972 году окончил Севмашвтуз. Работал инженером, старшим инженером, начальником бюро по организации труда, заместителем секретаря парткома стапельно-сдаточного производства.
Работая в основном стапельно-сдаточном цехе предприятия, Э. С. Борисов много внимания уделял внедрению в производство передовых достижений науки и новой техники в области судостроения.
12 августа 1988 года на пленуме горкома КПСС избирается первым секретарем горкома КПСС. В этой должности проработал с 1988 по 1991 год. Внес большой вклад в развитие инфраструктуры города. В этот период ежегодно строилось около 30 домов, Северодвинск регулярно признавался победителем Всесоюзного конкурса по благоустройству.
В 1997 году вернулся на Севмаш и возглавлял экономическую службу предприятия. Внес большой вклад в выполнение оборонных заказов, федеральной программы «Шельф» по производству специальной морской техники. В 2007 году временно исполнял обязанности директора Севмаша.
В феврале 2011 года по личному заявлению освобожден от должности заместителя генерального директора по экономике и программам развития и назначен первым замом начальника производственно-диспетчерского отдела.
Является председателем правления территориального объединения работодателей «Союз промышленников и предпринимателей г. Северодвинска», старшим советником генерального директора ОАО «ПО «Севмаш».
Звание «Почетный гражданин Северодвинска» присвоено решением городского Совета депутатов МО «Северодвинск» № 99 от 23.09.2010 года.
Награжден орденом «Знак Почета», медалями «300 лет Российскому флоту», «За создание атомного подводного флота России», «За подъем АПЛ «Курск», «Столетие подводных сил России», почетными грамотами администрации Архангельской области и МО «Северодвинск». Имеет звание «Заслуженный экономист РФ» (2005).